From 0e352c62ee42200aaa709d660ca66233b9d8d3da Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: =?UTF-8?q?Vojt=C4=9Bch=20Moravec?= <theazgra@gmail.com>
Date: Thu, 17 Jan 2019 14:08:23 +0100
Subject: [PATCH] Updated readme.
---
.gitignore | 6 ++++--
README.md | 17 ++++++++++++-----
docs/light_sheet_microscopy/B3D_compression.md | 2 ++
3 files changed, 18 insertions(+), 7 deletions(-)
diff --git a/.gitignore b/.gitignore
index f3cb28c..59b1b76 100644
--- a/.gitignore
+++ b/.gitignore
@@ -1,5 +1,7 @@
SimpleImageViewer/
[Dd]ebug
-[Rr]ebug
+[Rr]elease
*.exe
-*.czi
\ No newline at end of file
+*.czi
+B3D/
+czi_example_data/
\ No newline at end of file
diff --git a/README.md b/README.md
index 7868d49..74cc5cc 100644
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -1,7 +1,14 @@
-# irods_info
+# Data comression project
-Information about iRODS.
+## CZI format
+- Popsat formát CZI
+ - Co a jak je v tom formátu uloženo (jakýmy datovými typy atd.)
+ - Jak tam jsou vůbuc uložena obrazová data
+ - Je komprese součásti standardu, nebo dokumentace jen popisuje komprese, které mohou být použity? Jaké LZW? Jaký JPG? Co je to JPEG XR?
+ - Jak jsou uloženy nekompresované data? Celá číslá, realná číslá, enum?
+ - Jak jsou uložena kompresovaná data?
+ - Jak vytáhnout obrazová data z CZI souboru?
+ - Jaký je vztah mezi obrázky v CZI souboru?
+ - Dala by se použít nějaká komprese vzhledem k `referenčním` obrázkům? (vztah mezi obrazy, jak jsou posunuty atd.)
+- Možná se podívat co je to ten HDF5, ale spíš se zaměřit na CZI formát.
-- [ ] Read [technical overview](docs/technical-overview-2016-web.pdf)
-- [ ] Read [beginner training](docs/irods_beginner_training_2018.pdf) ?
-- [ ] Read online documentation.
\ No newline at end of file
diff --git a/docs/light_sheet_microscopy/B3D_compression.md b/docs/light_sheet_microscopy/B3D_compression.md
index 561a101..8a9d969 100644
--- a/docs/light_sheet_microscopy/B3D_compression.md
+++ b/docs/light_sheet_microscopy/B3D_compression.md
@@ -15,6 +15,8 @@
- signed or unsigned 8 bit or 16 bit integers
- HDF5 files
- *Probably all image types, but image must be loaded by CUDA.*
+- *New angle on lightsheet ...* paper citations:
+ - 3.32x average increase in compression ratio compared to lossless mode
### NOTE: Try compressing `czi` file with B3D.
--
GitLab