@@ -2,7 +2,7 @@ Jak již bylo zmíněno v úvodu této práce, v první sekci se budeme zběžn
\subsection{ZISRAW (CZI) formát}
\label{sec:czi_format}
Údaje uvedené v této sekce vychází z oficiální specifikace formátu CZI \cite{czi_spec}, společnosti Carl Zeiss ZEN software. Formát CZI byl vytvořen pro ukládání výsledku mikroskopických metod, tedy obrazů, vytvořených pomocí mikroskopů. Při jeho návrhu bylo také myšleno na metadata, která popisují jak samotnou obrazovou informaci, tak i postup jejího získání. Tímto postupem rozumíme podmínky, za kterých byl obraz pořízen. Jako příklad můžeme uvést zvolenou metodu mikroskopie, způsob nasvětlení vzorku, úhel snímání atd. Tato metadata jsou ukládána ve formátu XML s kódováním UTF-8 a vychází ze specifikace OME (\emph{Open Microscopy Environment})\cite{omeweb}.
Údaje uvedené v této sekce vychází z oficiální specifikace formátu CZI \cite{czi_spec}, společnosti Carl Zeiss ZEN software. Formát CZI byl vytvořen pro ukládání výsledku mikroskopických metod, tedy obrazů, vytvořených pomocí mikroskopů. Při jeho návrhu bylo také myšleno na metadata, která popisují jak samotnou obrazovou informaci, tak i postup jejího získání. Tímto postupem rozumíme podmínky, za kterých byl obraz pořízen. Jako příklad můžeme uvést zvolenou metodu mikroskopie, způsob nasvětlení vzorku, úhel snímání atd. Tato metadata jsou ukládána ve formátu XML s kódováním UTF-8 a vychází ze specifikace OME (\emph{Open Microscopy Environment})~\cite{omeweb}.
CZI formát vychází z ještě obecnějšího formátu ZISRAW, jehož hlavním cílem je umožnit přenos velkého množství dat v binární podobě. S tímto úmyslem byla navrhnutá struktura tohoto formátu, který se skládá z jednotlivých segmentů. Každý segment je identifikován svou hlavičkou, která obsahuje informace o bloku dat, který se nachází za ní. Navíc, pro rychlejších \linebreak navigaci v souboru existují speciální adresářové segmenty, které odkazují na polohu jednotlivých segmentů v souboru.
